首先，程朱理学强调“存天理，灭人欲”，这种观念在一定程度上压抑了个人情感与欲望的合理表达。尤其是在封建礼教森严的社会背景下，这一理论被过度解读，导致妇女地位进一步降低，如贞节观念的强化等现象。这不仅限制了女性的社会角色和发展空间，还加剧了性别不平等的问题。
其次，程朱理学过于注重道德教化而忽视实践能力培养，使得部分读书人陷入空谈心性、脱离实际的泥潭。这种倾向不利于科学技术的进步和社会生产力的发展，阻碍了社会向现代化转型的步伐。
再者，随着程朱理学成为官方正统思想后，其僵化的教条主义特征逐渐显现出来。一方面，它固化了阶层分化，使下层百姓难以通过科举改变命运；另一方面，也抑制了思想创新，形成了“万马齐喑”的局面。
综上所述，虽然程朱理学在中国历史上发挥了重要作用，但其某些极端化的主张确实给封建社会后期带来了不少负面影响。这些教训提醒我们，在传承优秀传统文化的同时，也要警惕其中可能存在的消极因素，以促进更健康和谐的社会发展。
