随着我国经济环境的变化和公共财政管理需求的提升，政府会计制度的改革成为必然趋势。《新政府会计制度》作为这一改革的重要成果，旨在提高政府财务信息的质量，增强透明度，并更好地服务于国家治理现代化的目标。然而，在实施过程中，权责发生制与收付实现制之间的冲突逐渐显现出来。

权责发生制强调的是根据权利或责任是否已经产生来确认收入或费用，这种方法能够更准确地反映政府在某一特定期间内的实际业绩情况。而收付实现制则关注的是资金的实际流入流出，它操作简单且易于理解，在传统上被广泛应用于政府部门的日常财务管理中。两者各有优劣，在实践中如何协调它们的关系成为了一个亟待解决的问题。

首先，从理论层面来看，权责发生制能够提供更加全面、准确的信息，有助于决策者做出基于事实依据的战略规划；但与此同时，其复杂性也给实际操作带来了挑战。相比之下，收付实现制虽然便于执行，却可能因为未能充分考虑某些未支付的成本或尚未收到的收入而导致信息失真。

为了有效应对上述矛盾，《新政府会计制度》提出了一系列措施来促进两种方法之间的平衡。例如，通过建立完善的预算管理体系，确保即使采用收付实现制也能大致反映出真实的财政状况；同时，加强内部控制机制建设，以减少因执行权责发生制而导致的操作风险。

此外，还应当注重培养专业人才，提高相关人员对于新型会计准则的理解能力和应用水平。只有当所有参与者都能够正确理解和运用这些规则时，才能真正实现新旧体制之间的顺利过渡和平稳运行。

总之，《新政府会计制度》中的权责发生制与收付实现制之间的关系并非对立而是互补的。通过不断探索和完善相关配套政策，我们相信可以找到一条既能满足现代财政管理需求又能兼顾实际操作便利性的道路。这不仅有利于改善公共服务质量，也将为推动整个社会经济健康发展作出积极贡献。